منطق التجريد ياتي (۳۷) أنوار الملكوت في شرح الياقوت لإبراهيم النوبختي في الكلام (۳۸) مقصد الواصلين أو مقاصد الواصلين في معرفة أصول الدين (۳۹) منهاج الهداية و معراج الدراية في الكلام (۴۰) كشف الحق و نهج الصدق صنفه باسم السلطان الجايتو خربندا محمد غياث الدين المغولي كما صرح به في خطبته و هو الذي رده الفضل بن الروزبهان و رد على الفضل القاضي نور الله مطبوع ببغداد و لكن طابعه لم يحسن ترتيبه (۴۱) النهج الحق ذكره بعض تلاميذ الشيخ على الكركي و يمكن أن يكون هو الذي قبله فان صاحب البحار في مقدماته سماه نهج الحق و كشف الصدق (۴۲) الهادي ذكره بعض تلاميذ الكركي أيضا و [قال ]صاحب الرياض لم أجده في مؤلفاته (۴۳) واجب الاعتقاد في الأصول و الفروع و عليه شرح للمقداد السيوري و عندنا منه نسخة مخطوطة عليها شرح لعبد الواحد ابن الصقي النعماني اسمه نهج السداد إلى شرح واجب الاعتقاد. في الرياض هي رسالة صغيرة معروفة و عليها شروح عديدة و هي غير رسالة واجب الاعتقاد الكبير لولده (۴۴) تحصيل السداد شرح واجب الاعتقاد المذكور مطبوع معه (۴۵) منهاج الكرامة أو تاج الكرامة في إثبات الامامة و سماه صاحب كشف الظنون منهاج الاستقامة مطبوع مستقلا و على هامش بعض طبعات الألفين صنفه باسم السلطان الجايتو محمد غياث الدين المغولي و هو الذي رد عليه ابن تيمية بكتاب سماه منهاج السنة و رد على منهاج السنة السيد محمد مهدي القزويني المعاصر بكتاب سماه منهج الشريعة في مجلدين مطبوع (۴۶) كتاب الألفين الفارق بين الصدق و المين ذكر فيه ألف دليل على إمامة ضمير [أمير] المؤمنين (ع) و ألف دليل على إبطال شبه المخالفين و رتبه ولده فخر المحققين محمد بن الحسن و لم يكن مرتبا. و ليس الموجود في النسخ المتداولة من الألف الثاني إلا يسير و الظاهر إن ولده لم يظفر ببقيته أو إن تاليفه لم يتم ففي آخر إحدى النسخ المطبوعة فهذا آخر ما أردنا إيراده في هذا الكتاب من الأدلة الدالة على وجوب عصمة الامام و هو ۱۰۳۸ دليلا و هو بعض الأدلة فان الأدلة على ذلك لا تحصى و هي براهين قاطعة لكن اقتصرنا على ألف دليل لقصور الهمم عن التطويل و ذلك في غرة رمضان المبارك سنة ۷۱۲ و كتب حسن بن مطهر ببلدة جرجان في صحبة السلطان الأعظم غياث الدين محمد أولجايتو خلد الله ملكه و كتب ولده فخر الدين بعد هذا الكلام ما صورته: هذا صورة خط المصنف والدي قدس الله سره و كتب هذا من النسخة بياضا و وافق الفراغ منه في ۱۷ ربيع الأول من سنة ۷۵۴ بالحضرة الشريفة الغروية صلوات الله على مشرفها و الحمد لله وحده.
و كتب ولد فخر الدين بعد هذا الكلام: هذا صورة خط والدي ادام الله أيامه (۴۷) الرسالة السعدية في الكلام مطبوعة صنفها باسم سعد الدين الساوجي وزير غازان و اولجايتو و عندنا منها نسخة مخطوطة قال في أولها: أوضحت في هذه الرسالة السعدية ما يجب على كل عاقل اعتماده في الأصول و الفروع على الإجمال و لا يحل لأحد تركه و لا مخالفته في كل حال (۴۸) التناسب بين الأشعرية و فرق السوفسطائية (۴۹) الباب الحادي عشر في أصول الدين ألحقه بمختصر مصباح المتهجد المسى [المسمى ]بمنهاج الصلاح الآتي في كتب الأدعية لان المختصر عشرة أبواب فالحق به الباب الحادي عشر في أصول الدين مطبوع مع شرح المقداد السيوري عليه مرارا لا تحصى و عليه شروح أنهاها صاحب الذريعة إلى ۲۲ شرحا (۵۰) استقصاء النظر في القضاء و القدر و في الخلاصة استقصاء البحث و النظر عندنا منه نسخة و كأنها هي التي سماها بعضهم رسالة إبطال الجبر الفها للشاه خربندا الجايتو محمد لما ساله بيان الأدلة الدالة على ان للعبد اختيارا في أفعاله و إنه غير مجبور عليها و ألف بعض علماء الهند من غير الشيعة كتابا في رده فألف القاضي نور الله كتابا في الرد على الرد سماه النور الأنور و النور الأزهر في تنوير خفايا رسالة القضاء و القدر و زيف فيه اعتراضات الهندي على العلامة الحلي (۵۱) رسالة في خلق الأعمال (۵۲) منهاج السلامة إلى معراج الكرامة مذكور في كشف الظنون (۵۳) رسالة تحقيق معنى الايمان و نقل الأقوال فيه رآها صاحب الرياض في بلدة هراة و هي بخط بعض تلاميذ الشيخ حسين بن عبد الصمد العاملي (۵۴) أربعون مسألة في أصول الدين (۵۵) إيضاح مخالفة السنة يمكن عده من كتب الاحتجاج و الجدل لاشتماله على بيان مخالفات لنص الكتاب و السنة و يمكن عده من كتب التفسير لما فيه من تفسير الآيات و بيات مداليلها. في أمل الآمل. رأينا له نسخا منها نسخة قديمة في الخزانة الموقوفة الرضوية سلك فيه مسلكا عجيبا و الذي وصل إلينا منه هو المجلد الثاني و فيه سورة آل عمران لا غير.
آداب البحث
(۵۶) رسالة في آداب البحث مختصرة.
كتب التفسير
(۵۷) نهج الايمان في تفسير القرآن في الخلاصة ذكرنا فيه ملخص الكشاف و التبيان و غيرهما و التبيان هو تفسير الشيخ الطوسي (۵۸) القول الوجيز أو السر الوجيز في تفسير الكتاب العزيز. و مر أن له إيضاح مخالفة السنة يصلح أن يعد من كتب التفسير و من كتب الاحتجاج و الجدل و ذكر بعضهم إنه رأى له تلخيص الكشاف و الظاهر إنه المتقدم.
كتب المعقول
(۵۹) القواعد و المقاصد في المنطق و الطبيعي و الالاهي (۶۰) الأسرار الخفية في العلوم العقلية من الحكمة و الكلام و المنطق مجلد يرد به على الفلاسفة ألفه باسم هارون بن شمس الدين الجويني نسخته بخط المؤلف في الخزانة الغروية (۶۱) كاشف الأستار في شرح كشف الأسرار مجلد (۶۲) الدر المكنون في علم القانون في المنطق (۶۳) المباحثات السنية و المعارضات النصيرية (۶۴) المقاومات. في الخلاصة باحثنا فيه الحكماء السابقين و هو يتم مع تمام عمرنا (۶۵) حل المشكلات من كتاب التلويحات (۶۶) إيضاح التلبيس من كلام الرئيس في الخلاصة: باحثنا فيه الشيخ ابن سينا [هكذا] في الخلاصة و في إجازة مهنا كشف التلبيس و بيان سهو الرئيس (۶۷) مراصد التدقيق و مقاصد التحقيق في المنطق و الطبيعي و الالاهي (۶۸) المحاكمات بين شراح الإشارات ثلاثة مجلدات (۶۹) كشف الخفا من كتاب الشفا في الحكمة لابن سينا خرج منه مجلدات (۷۰) القواعد الجلية في شرح الرسالة الشمسية في المنطق (۷۱) الجوهر النضيد في شرح منطق التجريد (۷۲) نهج العرفان في علم الميزان في المنطق (۷۳) إيضاح المقاصد من حكمة عين القواعد و هو شرح لكتاب حكمة العين للكاتبي القزويني ذكره صاحب كشف الظنون فقال في حرف الحاء حكمة العين للكاتبي القزويني المتوفى ۶۷۵ أوله: سبحانك اللهم يا واجب الوجود ذكر فيه إن جماعة من الطلبة لما فرغوا من بحث الرسالة المسماة بالعين في المنطق من تاليفه التمسوا منه ان يضيف إليها رسالة في الالاهي و الطبيعي فأجاب ثم قال و من شروحه شرح جمال الدين حسن بن يوسف