من نفس الشّمس ظهر من نور حقيقة ذلك الوجود الأقدس بمقتضى علمه و إرادته جوهر مجرّد محيط بجميع الموجودات الّتى هى تحت الملكوت الاعظم، احاطة العلّة بمعلولها و هو الّذى يسمّونه بالعقل الاوّل و المعلول الاوّل.
و ذكر بعضهم انّه ظهر من هذا المعلول الاوّل جوهر ان أحدهما مجرّد و هو العقل الثّانى، و الآخر مادّى و هو فلك الافلاك المحيط بجميع السّماوات و الارض، و هكذا ظهر من كلّ عقل عقل و فلك الى ان انتهى الامر إلى العقل العاشر فصارت العقول عشرة، و الافلاك تسعة، و العقل العاشر عندهم هو مبدأ العناصر و العالم السّفلى، و يسمّونه بالعقل الفعّال ثم لم يظهر جوهر عقلى من هذا العقل إلا انّه متى حدث فى مادّة استعداد تعلّق نفس بها أفيض عليها من هذا العقل نفس، فعند الشّيخ عدد العقول عدد مجموع الأفلاك بزيادة واحد آخر هو العقل الفعّال و حركات الافلاك عند الشيخ و سائر المشّائين اراديّة، و الافلاك و الكواكب بجملتها عندهم أصحاب شعور و إرادة كما ينسب إلى الشّيخ فى هذا المعنى قوله:جعل و خنفساء و مور زبونهمه جان‌دار و اين فلك بيجان!و اعتقدوا فى كل فلك أيضا وجود روحانيّات كثيرة، و نفوس قدسيّة غير محصورة و هذه الطّبقة من الحكماء قائلون بحياة النّفوس البشريّة و بقائها بعد مفارقتها الأبدان، و يقولون بالثّواب و العقاب الرّوحانيّين و انّها! يجرى بمقتضى أعمالها فى الدّنيا إن خيرا فخيرا و ان شرا فشرا إلى أن قال:
و قد تمسّك الشّيخ فى رسالة له كتبها فى الصّلاة بالأدلّة النقليّة و الاعتراف بالنبوّة و سائر اركان الدّين ظاهر من سائر مؤلّفاته و له فى العلوم العقليّة تصانيف مشهورة مثل «الشّفاء» و «الاشارات» و «القانون» و «عيون الحكمة» و «التّعليقات» و «الموجز الكبير» و له أيضا فى العلوم الغريبة مؤلّفات مثل «كنوز المعزمين» و «رسالة فى عمل التّأليف و التّبغيض» و تعليقات متفرّقة فى خواص الأعداد، و قد صحّ بعضها بتجربة المؤلّف و قد انتهى بعض مسائل الهيئة و النّجوم الّتى استند فيها بطلميوس الحكيم و غيره بادلّة