تكتب ما ذكر في هذه المسألة من الشهرة و الأقوال و الإجماعات و تورد جميع ما تجده في الوافي و الوسائل من الروايات و سماها العصرة في العصير و وجدت عليها بخط شيخه الشيخ حسين نجف ما لفظه: من فضل الله علي ان وفقت للنظر فيها و تطلعت على أسرار معانيها و لقد علقت بها و تصفحتها فوجدتها روضة غناء و حديقة فيحاء لم تسمح قريحة بمثلها و لم نر في هذا المضمار على طرزها و لقد أزاحت الشك و الشبه و الريب و تجلى بها إلى الشهادة ما كان العلم به من الغيب فلله درة ما احقه بعظيم الأجر و جزيل الجزاء و جميل الذكر و حسن الثناء حرره ذو التفريط و السرف أقل الطلبة حسين نجف و عليها تقريظات اخر تركناها خوف الاطالة (۷) رسالة في المواسعة و المضايقة كتبها بالتماس شيخه صاحب الرياض و سماها الرحمة الواسعة في المضايقة و المواسعة و أشار إليها في مفتاح الكرامة و قال بينا فيها أدلة الأقوال في المسألة و ما يرد عليها و استوفينا الكلام أكمل استيفاء و قال أيضا: و قد استوفينا ذلك كله في الرسالة و ذكرنا اخبار الأقوال كلها و بينا الحال فيها بما لا مزيد عليه حتى اتضح الحال و اندفع الاشكال و كانت حرية بما سميناها به و هو الرحمة الواسعة في مسألة المضايقة و المواسعة (۸) حواش على الروضة على كتاب المضاربة و الوديعة و العارية و المزارعة و المساقاة و بعض الوصايا و تمام النكاح و بعض الطلاق تقرب من نصف الروضة (۹) منظومة في الرضاع تقرب من مائة و أربعين بيتا (۱۰) منظومة في الخمس تقرب من ثمانين بيتا نظمها باسم استاذه بحر العلوم أولها:الحمد لله و صلى الباريعلى النبي الطاهر المختارإلى قوله:فهاك راق في الرضاعليسهل الحفظ على الطباعإلى قوله:من يمن مولانا عظيم الأجرالسيد المهدي فخر العصر(۱۱) منظومة في الزكاة تقرب من مائة و عشرة أبيات قال في مدحها بعض الفضلاء:و منظومة غراء تزهو كأنهاقلائد تبر في ترائب أبكارو تعلو على أمثالها ان تلوتهافتبصر نظما لا يمل بتكرار(۱۲) رسالة حقق فيها مسألة جواز العدول عن العمرة عند ضيق الوقت إلى الأفراد (۱۳) شرح الوافية في الأصول مجلدان أكبر من القوانين تام على الظاهر الا قليلا بسط فيه الكلام و تعرض لأغلب كلمات الأساطين من الأصوليين و الأخباريين المتقدمين و المتأخرين شارحي الوافية و غيرهم و ذكر فيه جميع ما وقع من المباحثة و المناظرة بين العلمين العيلمين الشيخ الأكبر الشيخ جعفر و السيد الفاضل المتقن السيد محسن البغدادي في جريان أصل البراءة في اجزاء العبادات و أول الموجود منه بخطه الشريف في بطن الورقة قوله: لا يقال اختلاف المتعلق إلخ و آخره في التراجيح (۱۴) رسالة في تحقيق مسألة الشك في الشرطية و الجزئية في العبادات و ذكر فيها مباحثته في ذلك مع شيخيه صاحب الرياض و بحر العلوم (۱۵) رسالة ذكر فيها مناظرة الشيخ الأكبر الشيخ جعفر و الفاضل المتقن السيد محسن الكاظمي بالتمام و ما تكاتبا به بعض المسائل و فيها ورقة بخط الشيخ جعفر بيده (۱۶) حاشية صغيرة على أول تهذيب الأصول (۱۷) حاشية على المعالم في مقدمة الواجب (۱۸) رسالة في علم التجويد طبعت بمصر (۱۹) رسالة في الرد على الأخباريين نافعة جدا و كتب المحقق البغدادي على ظهرها بخطه أحسنت و أجملت و أفضلت حكمة و صوابا و موردا عذبا و مستزادا لبابا لا زلت موفقا لهداية الخلق و إرشاد الناس إلى الحق و الكشف عن الخفايا و الدلالة على الخبايا و كتب على ظهرها بعض الأفاضل:بقيت على الدهر يا ابن النبيو هذا دعا شامل للأنامو لا زلت تحمي حمى المكرماتو تنهج منهجها للكرامخصمت و قد طال داء النزاعبمنطق فصل ألد الخصامو لا غرو إذ لم تزل دائباشموس نهارك تجلو الظلامو كم رضت في العلم صعب القيادو دون ذويه ملكت الزمامفهم درجات لكل مقامو ان مقامك أعلى السنام(۲۰) رسالة وجوب الذب عن النجف الأشرف و إثبات انها بيضة الإسلام مختصرة كتبها من حفظه و لم تكن عنده كتبه (۲۱) رسالة فيما جرى بينه و بين صاحب الرياض في مسألة أفتى بها صاحب الرياض و خطاه المترجم و تراد الكلام بينهما سؤالا و جوابا حتى رجع صاحب الرياض إلى قوله (۲۲) رسالة في أصل البراءة ذكر فيها أولا كلام السيد محسن الأعرجي ان الشغل اليقيني يستدعي البراءة اليقينية و تكلم في الرد عليه ثم أورد ما كتبه السيد محسن في الجواب عنه ثم أورد جوابه و هكذا إلى آخر الكتاب بعنوان قال سلمه الله و أقول: ذكرها صاحب الذريعة و قال ان النسخة موجودة عند الشيخ هادي آل صاحب كشف الغطاء و انها كتبت عن نسخة الأصل التي عليها حواش بإمضاء محمد تقي و المظنون انها للشيخ محمد تقي صاحب حاشية المعالم انتهى. هذا ما وقفنا عليه من مصنفاته. و عد فيها صاحب روضات الجنات تعليقات كثيرة على القوانين و هو اشتباه كما عرفت.
مكتبته
كانت له مكتبة غنية بكتب الفقه و الحديث و الرجال و غيرها حاوية لجميع كتب الفقه و الحديث أو جلها للقدماء و المتأخرين كما يدل عليه نقله عنها في مفتاح الكرامة بغير واسطة و كلها كانت مخطوطة لأن فن الطباعة لم يكن قد انتشر يومئذ.
أشعاره
له أشعار جيدة منها ما كتبه بخطه الشريف على مجلدات مفتاح الكرامة فعلى مجلد الشركة قوله من أبيات:و برق ضئيل الطرتين تخالهمخاريق مطرود بليل و طاردذكرت به صحبي عشية قوضواعلى متن محمول على متن ساعدو انقذني من ربقة الجهل اننيأبيت الليالي ساهرا غير راقدألاحظ أسفار الذين تقدمواو انظر فيها واحدا بعد واحدفلست ترى في العصر من جمع الذيجمعت و في الآثار أصدق شاهدأ في الشمس شك انها الشمس عند ماتجلت عيانا للبصير المشاهدو على المجلد المذكور أيضا تقريض على الشرح المزبور:كتاب لباغي الفقه أقصى مرادهو يغني به عن جده و اجتهادهكحلت له جفني بميل سهادهو خصبت كفي دائما من مداده